一次堆肥阶段的特点是：高氧气吸收率，高温，可降解挥发性固体（BVS）大量i减少，粪便处理设备，高的臭味潜力。通常，一次堆肥阶段由于需要减少臭气，动物粪便处理设备，因此需要提供通气和保持对堆肥过程的良好控制。二次堆肥阶段的特点是：温度低，氧气吸收率低，臭味潜力低。相对一次堆肥来讲，二次堆肥阶段的管理和调控比较简单，然而从工程角度看，不能没有二次堆肥，因为二次堆肥阶段可继续降解那些难降解的有机物，还要克服反应速率变慢以及重建低温微生物群落，从而有助于堆肥腐熟、减少植物毒性物质和抑制病原菌，这两个阶段对一个完整的堆肥系统的设计和操作来说是缺一不可的，而且是生产腐熟堆肥所必需的。

一次堆肥开始之前的原料处理称为前处理，后熟阶段之后的原料处理成为后处理。前处理或后处理是否需要依赖于原料的特点和期望的产品质量。

农用秸秆的有机质含量高，富含农作物生长所需的营养元素，几乎不含杂质，是堆肥的较佳原料，其堆肥产品的农用价值较高。秸秆类具有低水份的特点，大约为8%~15%。稻秸和稻壳的C/N为110~120，比适合堆肥的C/N值高。可以说，禽畜粪便处理设备，秸秆类不适合单独作为堆肥的原材料。稻壳是用来保护米的，粪便处理设备，因此含有很硬的硅酸质。若不加工就处理的化，吸水率不高，仅为75%~85%，堆肥化需要很长的时间。但粉碎后，吸水率为130%~250%。

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