二代测序仪的操作流程

  北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年，是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司，我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等，公司尤其在 ABI 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。

 

    1）测序文库的构建（Library Construction）

　　首先准备基因组DNA（虽然测序公司要求样品量要达到200ng，但是Gnome Analyzer系统所需的样品量可低至100ng，能应用在很多样品有限的实验中），然后将DNA随机片段化成几百碱基或更短的小片段，并在两头加上特定的接头（Adaptor）。如果是转录组测序，则文库的构建要相对麻烦些，RNA片段化之后需反转成cDNA，然后加上接头，或者先将RNA反转成cDNA，然后再片段化并加上接头。片段的大小（Insert size）对于后面的数据分析有影响，abi 3730测序仪，可根据需要来选择。对于基因组测序来说，通常会选择几种不同的insert size，以便在组装（Assembly）的时候获得更多的信息。

　　2）锚定桥接（Surface Attachment and Bridge Amplification）

　　Solexa测序的反应在叫做flow cell的玻璃管中进行，flow cell又被细分成8个Lane，dna测序仪，每个Lane的内表面有无数的被固定的单链接头。上述步骤得到的带接头的DNA 片段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构，以供后续的预扩增使用。

　　3）预扩增（Denaturation and Complete Amplification）

　　添加未标记的dNTP 和普通Taq 酶进行固相桥式PCR 扩增，单链桥型待测片段被扩增成为双链桥型片段。通过变性，释放出互补的单链，锚定到附近的固相表面。通过不断循环，将会在Flow cell 的固相表面上获得上百万条成簇分布的双链待测片段。

　　4）单碱基延伸测序（Single Base Extension and Sequencing）

　　在测序的flow cell中加入四种荧光标记的dNTP 、DNA 聚合酶以及接头引物进行扩增，在每一个测序簇延伸互补链时，每加入一个被荧光标记的dNTP就能释放出相对应的荧光，测序仪通过捕获荧光信号，并通过计算机软件将光信号转化为测序峰，从而获得待测片段的序列信息。

　　5）数据分析（Data Analyzing）

　　这一步严格来讲不能算作测序操作流程的一部分，但是只有通过这一步前面的工作才显得有意义。测序得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列，要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的Contigs甚至是整个基因组的框架，或者把这些序列比对到已有的基因组或者相近物种基因组序列上，并进一步分析得到有生物学意义的结果。

北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务，主营产品型号：有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。

测序仪

      北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年，测序仪，是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司，我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。

      测序仪日常怎么维护？      

      1、测序仪需要定期换胶；2、测序仪需要定期更换BUFFER；3、测序仪的废液和水要定期更换；4、泵的清洗.

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DNA测序仪试剂器材

      北京拓普塞斯生物技术有限公司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等

      1．bigdye测序反应试剂盒 主要试剂是bigdye mix，内含pe专利四色荧光标记的ddntp和普通dntp，amplitaq dna polymerase fs，反应缓冲液等。  

      2．pgem-3zf (+) 双链dna对照模板 0.2g/l，试剂盒配套试剂。  3．m13(-21)引物 tgtaaaacgacggccagt，abi 测序仪，3.2μmol/l，即

      3.2pmol/μl，试剂盒配套试剂。  

      4．dna测序模板 可以是pcr产物、单链dna和质粒dna等。模板浓度应调整在pcr反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒dna，浓度为0.2g/l，即200ng/μl。

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