首先，降低了鸡粪的改土作用，还易造成肥料的浪费。鸡粪中含有大量的有机质，深翻入土后能有效地改善土壤板结、减轻盐害症状，达到改土、沃土的作用。而且鸡粪中含氮量较大，如果将其长时间暴露在空气中，极易造成氮肥的损失，降低肥效。　　　　

其次，露在地表的鸡粪容易产生有害气体，对定植后幼苗植株的根系和叶片影响很大。而及时将鸡粪翻入土壤，在土壤微生物的作用下，有利于鸡粪的快速腐熟，而且土壤具有很强的吸附性，鸡粪腐熟过程中产生的氨气等有害气体会被土壤吸附转化，氨气等不能进入空气，也就不会出现气害了。　　　

所以，菜农在棚中使用干鸡粪时，最好是施入地里以后立即进行深翻，然后浇水促进其腐熟发酵，这样经过1-2周的时间，让这些粪肥发酵腐熟完全。另外，鸡粪在腐熟发酵过程中产生的氨气，还会被土壤中的硝化细菌转化为硝态氮，不仅能被作物吸收利用，避免造成浪费，同时还能避免在腐熟发酵过程中造成的蔬菜伤根、熏苗等肥、气害，一举两得。