耕地质量的退化，土壤有机质含量的下降，导致了土壤保水保肥能力的降低，风侵、水侵加剧，形成恶性循环。肥料、水分流失严重，水、肥利用率下降。当前，我国化肥的有效利用率远远低于发达国家水平。国内化肥，氮、磷、钾的投入比例为1：0.41：0.27，与合理施肥水平还有一定差距，尤其是钾肥的投入比例较小，也是影响肥料利用率不高的重要因素。

有机肥是营养肥料，有利于平衡土壤养分含量的增加，改善土壤结构和透气保水性，改善土壤微生态系统，增加土壤有益微生物。 因此，现有的有机资源充分利用科学的方法进入高品质的有机肥料，是为了解决资源浪费，环境污染，改善土壤的关键环节。 根据对世界和中国农业形势的分析，中国未来农业只能靠科技来保护食品安全，生态安全和农民收入，采取集约化和可持续发展的农业。

中国有数千年的有机农业基础，完全能够结合有机和无机生态农业，避免西方石油农业的缺点，传统农业和现代科技的本质结合起来，把自身特色的农业道路， 中国未来农业发展方向。 因此，在有些地区，适当减少化肥，特别是化肥氮肥的应用，提高作物产量和质量，改善农业生态环境可能比化肥更重要。 但如果适用不当，可能会增加生产效果，甚至无效。